方春
方春，女，1981年4月出生，湖北荊州人，工學(xué)博士，副教授，碩士生導(dǎo)師，2014年3月畢業(yè)于日本早稻田大學(xué)。2017年至2019年在日本東京大學(xué)任JSPS研究員，2023年3月至2024年3月在早稻田大學(xué)做訪問學(xué)者。2021年7月至今任教于北京石油化工學(xué)院信息工程學(xué)院，現(xiàn)在計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系工作。主要研究領(lǐng)域?yàn)榇髷?shù)據(jù)分析、智能計(jì)算、生物信息學(xué)等研究。作為課題負(fù)責(zé)人完成國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金1項(xiàng)、日本學(xué)術(shù)振興會(huì)JSPS學(xué)者項(xiàng)目1項(xiàng)，山東省自然科學(xué)基金青年項(xiàng)目1項(xiàng)、留學(xué)基金委訪學(xué)項(xiàng)目1項(xiàng)；參與國(guó)家自然科學(xué)基金和省部級(jí)項(xiàng)目7項(xiàng)；指導(dǎo)學(xué)生完成國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練項(xiàng)目2項(xiàng)，發(fā)表科研論文40余篇，其中SCI收錄論文期刊論文20余篇。
I. 主要研究工作
1. 圖像、文本大數(shù)據(jù)分析和模式識(shí)別；
2. 智能計(jì)算方法在生物數(shù)據(jù)中的應(yīng)用研究。
II. 承擔(dān)科研項(xiàng)目
1. 國(guó)家留學(xué)基金委訪問學(xué)者計(jì)劃（項(xiàng)目號(hào)：202208110076），項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2023.03-2024.02。
2. 企業(yè)橫向項(xiàng)目：智能洗滌支持軟件和技術(shù)開發(fā)，項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2025.01-2027.12。
3. 日本國(guó)家基金--JSPS特別研究員項(xiàng)目：膜蛋白質(zhì)天然變性領(lǐng)域的預(yù)測(cè)和分析(合作單位:東京大學(xué))（項(xiàng)目號(hào)：P17050），項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2017.8-2019.8。
4. 國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目：天然無序蛋白質(zhì)無序區(qū)域及其分子識(shí)別特征域的預(yù)測(cè)算法研究（項(xiàng)目號(hào)：61602280），項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2017.01-2019.12。
5. 山東省自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目：基于序列信息的天然無序蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)的預(yù)測(cè)（項(xiàng)目號(hào)：ZR2014FQ028），項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2015.01-2017.12,
6. 山東省軟件工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（山東大學(xué)）聯(lián)合開放基金項(xiàng)目、固有無序蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)的識(shí)別研究。項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，2016.10-2018.09.
III. 代表性學(xué)術(shù)論文
1. Fan Zhang, Jinfeng Li, Chun Fang*, DeepTree-AAPred: Binary tree-based deep learning model for anti-angiogenic peptides prediction. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 2025,108982(137):1-10.
2. YiMing Wang,Chun Fang*, Cycle-ESM: Generation-assisted classification of antifungal peptides using ESMprotein language model,Computational Biology and Chemistry，2024，108240（113):1-10.
3. Fan Zhang, Jinfeng Li，Zhenguo Wen，Chun Fang*, FusPB-ESM2: Fusion model of ProtBERT and ESM-2 for cell-penetrating peptide prediction Computational Biology and Chemistry,2024，1(111):1-9.
4. Chun Fang*, Jiasheng He, Hayato Yamana. MoRF_ESM: Prediction of MoRFs in disordered proteins based on a deep transformer protein language model,Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2024,2(22):1-17.
5. Jiasheng He, Shun Zhang, Chun Fang*, PPII: Predicting polyproline type II helix structure based on amino acid indexes with an improved BiGRU-TextCNN model,2023,JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY,5(21):2350022-1-19.
6. Fan Zhang, Ruiqing Yan, Jinfeng Li, Jiasheng He,Chun Fang*, GAMFlow: Global Attention-Based Flow Model for Anomaly Detection and Localization IEEE ACCESS，2023,11(11）：116608-116621
7. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li and Kentaro Shimizu. MoRFPred_en: Sequence-Based Prediction for MoRFs Using an Ensemble Learning Strategy [J], Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2020, 17(6):1-15.
8. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, AikuiTian, Caihong Li and Kentaro Shimizu.Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins with a deep convolutional neural network method [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2019, 17(1):1-16.
9. Chun Fang, Yoshitaka Moriwaki, Caihong Li, and Kentaro Shimizu, Prediction of Antifungal Peptides by Deep Learning with Character Embedding[J]. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2019,12:21-29.
10. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana. Condensing position-pecific scoring matrixs by the Kidera factors for ligand-binding prediction[J]. International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2015, 12(1), 70-84.
11. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Simplified Sequence-based method for ATP-binding Prediction Using Contextual Local Evolutionary Conservation [J], Algorithms for Molecular Biology, 2014, 9(7):1-16.
12. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, Conservation Patterns of proteins and Its Influence on Identifying Protein Functional Sites [J]. Journal of Bioinformatics and Computational Biology,2014,12(5) 1440003:1-18.
13. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, MFSPSSMpred: Identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins based on contextual local evolutionary conservation [J]. BMC bioinformatics, 2013,14 (300):1-16.
14. Chun Fang, Tamotsu Noguchi and Hayato Yamana, SCPSSMpred: A General Sequence-based Method for Ligand-binding Site Prediction [J], IPSJ Transactions on Bioinformatics, 2013, 6: 35-42.
IV. 招生信息
擬每年招收控制科學(xué)與工程學(xué)術(shù)型碩士1名，電子信息專業(yè)碩士1名。
